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MedeA 3.12.0 + license

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MedeA 3.12.0 + license

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Last edited by taiyue030 In 4/23/2026 22:42 Editor

MedeA 3.12.0 软件许可授权是材料原子模拟领域的领先环境。MedeA 支持专业的原子尺度和纳米级计算的日常部署,用于材料工程、材料优化和材料发现。在 MedeA 中,世界级的仿真引擎集成了复杂的属性预测模块、实验数据库、结构构建器和分析工具,全部集成在一个用户友好的环境中。
标准的 MedeA 环境包括以下模块:
  • 构建者:固体、表面、点缺陷、随机替换、聚合物、分子、层
  • 数据库:COD(晶体学开放数据库)
  • 作业控制:Jobserver/Taskserver(基于网页的作业控制和作业监控)
  • 计算引擎:LAMMPS 代码
  • 图形界面:LAMMPS GUI,图形工作流程编辑器
  • 分析:几何、对称性、空隙、点缺陷、轨迹、体积
计算引擎及相关图形界面
MedeA VASP,MedeA VASP GUI – 维也纳从始模拟包,图形用户界面
MedeA LAMMPS,MedeA LAMMPS GUI – 大规模原子/分子大规模并行模拟器,图形用户界面
MedeA GIBBS,MedeA GIBBS GUI – 用于流体属性预测与吸附的蒙特卡洛大标准方法,图形用户界面
MedeA MOPAC,MedeA MOPAC GUI – 半经验量子化学方法用于快速性质预测与筛选,图形用户界面
MedeA Gaussian 图形界面 – 基于流程图的图形界面 GAUSSIAN,一款通用计算化学软件包
MedeA 提供若干可选属性模块用于属性预测和自动化
属性模块 与 VASP 的属性模块:
MedeA MT – 机械、热性能
MedeA 声子 – 振动性质与热力学函数
MedeA 电子学 – 三维电子分析、Seebeck系数、电子电导率、有效质量
MedeA 过渡态搜索 – 反应路径与过渡态
MedeA UNCLE – 单向晶体扩展 用于合金化、缺陷和构型无序
MedeA FFO – 力场优化器,包含与 LAMMPS 合作的 B3LYP 混合
属性模块:
MedeA 声子 – 振动性质与热力学函数
MedeA MT – 机械、热性能
MedeA UNCLE – 统一 CLuster 用于合金、缺陷、构型无序的膨胀
MedeA 扩散 – 扩散系数自动计算
MedeA 热导率 – 热导率系数自动计算
MedeA 粘度 – 自动计算粘度
MedeA 表面张力 – 自动计算表面张力
MedeA 内聚能密度(CED)– 自动计算内聚能密度
MedeA FFO – 力场优化器
MedeA 沉积 – 原子/粒子在材料表面
的自动沉积 基于相关性的性质模块:
MedeA P3C – 结合Bicerano方法
的聚合物性质 MedeA QT – 统计相关
性互动工具包 构建器:
MedeA 非晶材料构建器 – 非晶结构、聚合物、热固性
MedeA 对接 – 吸附系统
MedeA 界面构建器 – 异质晶界面和晶界) 作为附加组件提供。
MedeA 形态学 – 晶体形态
数据库
MedeA COD GUI – 晶体学开放数据库
MedeA ICSD – 无机晶体结构数据库
MedeA Pearsons – Pearsons 数据库
MedeA Pauling – The Pauling 数据库
MedeA NCD – NIST晶体数据库
MPDS – 数据科学材料平台(基于网络)
材料设计
msipd
NCD_Inorganic
NCD_Organic  


MedeA 3.12.0更新
开发者与编辑
  • 微结构构建器


    • 晶界处间隙原子的插入

    • 多块板结构的轻松创建

    • 旋转可以用 hkl 指标来表示


  • 自定义超级单体建造器:如果生成的超级单体是左手的(系统仍在建造中),会发出警告

  • 界面构建器


    • 其中包含一个包含扭转和倾斜两种类型(Σ值最高至Σ13)的重合点晶界模型(CSL)数据库。支持以下晶格类型

    • 模型可以通过指定大小、晶格参数和原子类型(元素)来进行定制

    • 多个晶界模型可以同时构建并保存在结构列表中

    • 构建器既可作为交互式工具,也可以作为流程图阶段使用


    • 面心立方(FCC),

    • 体心立方(BCC),

    • 六边形密堆积(HCP),

    • 简单三次曲线(SC),

    • 岩盐,

    • 锌闪石,

    • 沃尔茨派,

    • 镍矿,以及

    • 萤石


    • 高对称晶界构建器(新)


  • 扰动构建器(NEW)


    • 晶格参数(单元长度和角度)可以被随机扰动

    • 可以为所有或选定的原子设定磁矩

    • 原子位置(x, y, z)可以被随机扰动

    • 磁矩可以被随机扰动


    • 特别适合创建力场拟合和机器学习的训练集

    • 构建器既可作为交互式工具,也可作为流程图阶段使用


  • 非晶材料建造器


    • 检测大循环分子的增强



发动机
  • VASP


    • 波函数与重启电荷密度

    • MD延续的最终配置和速度

    • 用于持续即兴训练或改装的训练套装

    • 机器学习力场应用


    • 为降低原子环境信息的复杂度以提高效率,增加了控制措施:元素约化三体描述符和角度描述符

    • 质量评估现已基于溢出因子进行,既应用于应用,也在现场培训中进行

    • 现在,整个训练集使用结构列表,使得这与轨迹文件频率设置无关

    • MLFF选项的增强帮助文本,含关键词链接


    • 将机器学习力场(MLFF)导出为.frc文件,可用于MedeA LAMMPS模拟

    • 支持通过HDF5文件交换数据

    • 支持来自 libXC 便携式函数库中的交换相关函数(如 libxc.gitlab.io 的函数(DFT、metaGGA 和混合函数)

    • 支持DFT-D4范德华相互作用

    • 访问由libMBD提供的多体离散交互库


    • 新的二进制文件(VASP 6.5.1)提供了额外功能

    • MLFF增强

    • 流程图改进:

      VASP流程图阶段能够访问前一阶段和/或作业的文件,从而提升访问:

    • 核心级能量现已计算并在ListOfResults.sli结构列表中报告

    • 实现了系统无关的非默认用户频段选择

    • 通过为 ScaLAPACK 提供更大灵活性来提升性能

    • 集成的DOS数据及相关参数已被添加到DOS数据中,用于机器学习潜能的训练

    • 增强的自动更正程序,允许用户干预

    • 左手系统被禁止提交,并附有信息警告


  • 相位场


    • 温度随时间的变化是根据热容和热导率的函数计算的

    • 支持材料性质的温度依赖性(体积/晶界扩散、自由能、本征应变)

    • 可以定义边界条件和初始温度情景

    • 分析中支持三维相场结果的可视化


  • 兰姆普斯


    • 支持由VASP即时培训(MLFF)创建的机器学习潜能(MLP)

    • 支持ACE和GRACE(1L/2L)机器学习潜能


    • 提供新的二进制(2025年7月数据)

    • 对非标准取向的应力不确定性评估得到了增强

    • 角度和二面体分布的实时计算

    • 分子旋转半径的实时计算


  • 吉布斯


    • 增强在极大固体系统(单位胞在每个方向多次复制)上的吸收模拟;输出结构仅包含吸附物种



力场
  • MLPs(多层次管理计划)


    • LAMMPS支持GRACE 1L和2L MLPs。

    • VASP生成的MLP(MLFF)可用于VASP和/或LAMMPS

    • 基础(通用)机器学习电位 GRACE-1L-OMAT、GRACE-2L-OMAT、GRACE-1L-OAM 和 GRACE-2L-OAM 可用于 LAMMPS


  • MLPG


    • 在MLPG模块中,可以启用GRACE电位(1L/2L)的拟合


  • PCFF+


    • 硼酸、硼酸盐和硅酸盐离子的新参数,结合融合环脂肪族化合物的精细处理



属性模
  • P3C


    • 温度依赖性质的报告

    • 共聚物性质增强

    • 描述了统计拟合的质量

    • 属性和描述符的表化流程图变量


    • 性质如《高分子性质预测》(Jozef Bicerano)第18章所述:Tg、Td12、aT、密度、cp、溶解度1、g1、参考文献、diel、vpoisson298K、B298K、Eyoung298K Gshear298K、Bf298K、Sy298K、Eavis、PO2、PCO2和Tc。

    • 现在已报告共聚物的比热容(cp)

    • g1、Eyoung298K、Gshear298K、vpoisson298K、V、B298K、Bf298K 的更新提升了与参考数据的一致性

    • Td12和EyoungTgp30K的计算得到了改进


    • 温度依赖性质计算已添加到流程图P3C阶段;计算出的温度依赖性图表自动生成

    • 共聚物性质增强

    • 文档更新


  • 高分子专家


    • PEARL(聚合物专家模拟重复单元库)现已包含超过300万个重复单元。最新版本:2025-07-28


  • 叔叔


    • 新增了对精确地层热计算的支持

    • 训练集流程图信息的显示得到了增强


    • 新增了从前一阶段、作业或UNCLE结构列表恢复集群扩展优化的功能

    • 模型中所有元素的参考能量现在自动计算,确保所有列举结构的地层热准确

    • 空置抽样范围现在可以从“无空置”到定义的入住率,或从“仅有空置”到定义的入住率

    • 训练集流程图的状态会显示在界面中


    • 优化阶段

    • 计算属性阶段

    • 所有UNCLE阶段的总体改进



分析
  • 二元基地状态图分析(UNCLE)


    • 新增了一个控制键,可以在“总能量”、“伪热量”和“热量”之间切换

    • 已新增支持从“计算属性”阶段绘制带有颜色编码属性的数据

    • 随机混合能量曲线在可用时绘制出来

    • 高分辨率屏幕支持得到了提升


  • 蒙特卡洛温度曲线


    • 对高分辨率屏幕的支持得到了提升


  • 能带结构与声子色散图


    • 引入了样式面板,允许自定义测量线、费米线和轴的颜色、比例和大小。绘制范围和轴的位置可以微调,背景颜色也可以更改。样式可以重置、保存或加载

    • 对高分辨率屏幕的支持得到了提升


  • 相似性分析(NEW)


    • 列表(sli、fts、trj)的结构相似性可以通过检查

    • 可以生成更小的子集,包括代表结构

    • 作为交互式构建器和流程图阶段实现


  • 旋转半径(新)


    • 计算MD轨迹或结构列表中选定分子的旋转半径

    • 作为交互式构建器和流程图阶段实现


  • 几何分布(新)


    • 计算选定原子子集(单原子、对原子、三重态)的距离、角度和扭转

    • 作为交互式构建器和流程图阶段实现


  • 宪法描述符列表更新为包含Joback和P3C描述符


JobServer & TaskServer
  • TaskServer SLURM 封装脚本:引入了监控功能,用于跟踪提交任务在 SLURM 队列中的状态,确保顺畅执行

  • 大文件传输到JobServer的增强功能



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Download MedeA 3.12.0 software license crack package is the leading environment for the atomistic simulation of materials. MedeA enables professional, day-to-day deployment of atomic-scale and nano-scale computations for materials engineering, materials optimization and materials discovery. In MedeA, world-class simulation engines are integrated with elaborate property prediction modules, experimental databases, structure builders and analysis tools, all in one user-friendly environment.
The standard MedeA Environment includes the following modules:
Builders: Solids, surfaces, point defects, random substitution, polymer, molecules, layers
Databases: COD (Crystallography Open Database)
Job Control: Jobserver/Taskserver (web-based job control and job monitoring)
Compute engines: LAMMPS code
GUIs: LAMMPS GUI, graphical workflow editor
Analysis: Geometry, symmetry, void, point defects, trajectory, volumetric


Compute Engines and related GUIs
MedeA VASP, MedeA VASP GUI – Vienna Ab Initio Simulation Package, Graphical User Interface
MedeA LAMMPS, MedeA LAMMPS GUI – Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator, Graphical User Interface
MedeA GIBBS, MedeA GIBBS GUI – Grand Canonical Monte Carlo method for fluid properties prediction and fluid adsorption, Graphical User Interface
MedeA MOPAC, MedeA MOPAC GUI – Semi-empirical Quantum Chemistry method for fast property prediction and screening, Graphical User Interface
MedeA Gaussian GUI – Flowchart based GUI for GAUSSIAN, a general purpose computational chemistry software package
MedeA offers several optional Property Modules for property prediction and automation
Property Modules working with VASP:
MedeA MT – Mechanical, thermal properties
MedeA Phonon – Vibrational properties and thermodynamic functions
MedeA Electronics – 3D electronic analysis, Seebeck coefficients, electronic conductivity, effective masses
MedeA Transition State Search – Reaction pathways and transition states
MedeA UNCLE – UNiversal CLuster Expansion for alloying, defects, configurational disorder
MedeA FFO – Forcefield Optimizer and include B3LYP hybrid
Property Modules working with LAMMPS:
MedeA Phonon – Vibrational properties and thermodynamic functions
MedeA MT – Mechanical, thermal properties
MedeA UNCLE – UNiversal CLuster Expansion for alloying, defects, configurational disorder
MedeA Diffusion – Automated calculation of diffusion coefficients
MedeA Thermal Conductivity – Automated calculation of thermal conductivity coefficient
MedeA Viscosity – Automated calculation of viscosity
MedeA Surface Tension – Automated calculation of surface tension
MedeA Cohesive Energy Density (CED) – Automated calculation of cohesive energy density
MedeA FFO – Forcefield Optimizer
MedeA Deposition – Automated deposition of atoms/particles on materials surfaces
Property Modules base on Correlations:
MedeA P3C – Polymer properties from Correlations, employing the Bicerano method
MedeA QT – An interactive Toolkit for statistical correlations
Builders:
MedeA Amorphous Materials Builder – Amorphous structures, Polymers, Thermosets
MedeA Docking – Adsorbate systems
MedeA Interface Builder – Heterogeneous crystalline interfaces and grain boundaries) are available as add-ons.
MedeA Morphology – Crystal morphologies
Databases
MedeA COD GUI – Crystallography Open Database
MedeA ICSD – Inorganic Crystal Structure Database
MedeA Pearsons – The Pearsons database
MedeA Pauling – The Pauling database
MedeA NCD – The NIST Crystal Database
MPDS – Materials Platform for Data Science (web-based)
Materials Design
msipd
NCD_Inorganic
NCD_Organic












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The standard MedeA Environment includes the following modules:
Builders: Solids, surfaces, point defects, random substitution, polymer, molecules, layers
Databases: COD (Crystallography Open Database)
Job Control: Jobserver/Taskserver (web-based job control and job monitoring)
Compute engines: LAMMPS code
GUIs: LAMMPS GUI, graphical workflow editor
Analysis: Geometry, symmetry, void, point defects, trajectory, volumetric


Compute Engines and related GUIs
MedeA VASP, MedeA VASP GUI – Vienna Ab Initio Simulation Package, Graphical User Interface
MedeA LAMMPS, MedeA LAMMPS GUI – Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator, Graphical User Interface
MedeA GIBBS, MedeA GIBBS GUI – Grand Canonical Monte Carlo method for fluid properties prediction and fluid adsorption, Graphical User Interface
MedeA MOPAC, MedeA MOPAC GUI – Semi-empirical Quantum Chemistry method for fast property prediction and screening, Graphical User Interface
MedeA Gaussian GUI – Flowchart based GUI for GAUSSIAN, a general purpose computational chemistry software package
MedeA offers several optional Property Modules for property prediction and automation
Property Modules working with VASP:
MedeA MT – Mechanical, thermal properties
MedeA Phonon – Vibrational properties and thermodynamic functions
MedeA Electronics – 3D electronic analysis, Seebeck coefficients, electronic conductivity, effective masses
MedeA Transition State Search – Reaction pathways and transition states
MedeA UNCLE – UNiversal CLuster Expansion for alloying, defects, configurational disorder
MedeA FFO – Forcefield Optimizer and include B3LYP hybrid
Property Modules working with LAMMPS:
MedeA Phonon – Vibrational properties and thermodynamic functions
MedeA MT – Mechanical, thermal properties
MedeA UNCLE – UNiversal CLuster Expansion for alloying, defects, configurational disorder
MedeA Diffusion – Automated calculation of diffusion coefficients
MedeA Thermal Conductivity – Automated calculation of thermal conductivity coefficient
MedeA Viscosity – Automated calculation of viscosity
MedeA Surface Tension – Automated calculation of surface tension
MedeA Cohesive Energy Density (CED) – Automated calculation of cohesive energy density
MedeA FFO – Forcefield Optimizer
MedeA Deposition – Automated deposition of atoms/particles on materials surfaces
Property Modules base on Correlations:
MedeA P3C – Polymer properties from Correlations, employing the Bicerano method
MedeA QT – An interactive Toolkit for statistical correlations
Builders:
MedeA Amorphous Materials Builder – Amorphous structures, Polymers, Thermosets
MedeA Docking – Adsorbate systems
MedeA Interface Builder – Heterogeneous crystalline interfaces and grain boundaries) are available as add-ons.
MedeA Morphology – Crystal morphologies
Databases
MedeA COD GUI – Crystallography Open Database
MedeA ICSD – Inorganic Crystal Structure Database
MedeA Pearsons – The Pearsons database
MedeA Pauling – The Pauling database
MedeA NCD – The NIST Crystal Database
MPDS – Materials Platform for Data Science (web-based)
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